具体设计规则

长度：合成的PNA序列通常不超过18个碱基，接头、氨基酸和标记物不计入此限。

含有氨基酸：在序列的N端或C端可以添加一个赖氨酸或半胱氨酸。

嘌呤含量：富含嘌呤的PNA易发生聚合反应，并且水溶性差。为避免聚合反应，请遵循以下原则：将嘌呤含量限制在60%以下。例如，序列GATTAGCAGTCTACG是可行的（嘌呤含量<60%），而连续嘌呤应不超过4个，鸟嘌呤不超过3个。例如，ATTAGGGGCATCTAC（不可行，连续4个G）和CTAGATAGAAGGTTC（不可行，连续6个嘌呤）。如无法避免这些规则，可考虑使用探针的互补链。例如，GTAGATGCCCCTAAT（可行，上述序列的互补序列）和GAACCTTCTATCTAG（可行，上述序列的互补序列）。

避免自我互补序列：如反向重复、发夹和回文序列。由于PNA/PNA相互作用强于PNA/DNA，这类探针容易发生聚合。四个碱基互补是可行的，但仅限于除含C和G的情况外。当它们之间有一个或多个碱基间隔时也可行。例如，GATAATTGCA（可行，四个碱基互补），而GATCCGGTAC（不可行，只有CCGG互补），TATCCTGGTA（可行，CC与GG之间有一个碱基）。

六个及以上碱基的互补是不被允许的。例如，CTATTAATGCA（不可行，6个碱基互补）。但当间隔为一个或多个碱基时，六个碱基互补可行，除非只包含C和G。例如，AGTGCTACT（可行，有间隔）。至于GCGGCTCGC（不可行，仅G和C互补），即使有间隔，八个碱基互补也是不可行的。例如，ACTGTCAGT（不可行，8个碱基互补）。

一般规则

我们强烈建议设计反向平行的PNA探针。PNA可以向任一方向形成双链，但反向平行取向更为优先，形成常见的双链构造。在反义和DNA探针类型的应用中，反向平行是最优先考虑的构型。当取向为反向平行时，PNA探针的N端对应DNA的5’端。

值得注意的是，PNA的熔点与DNA不同。由于PNA链是不带电的，PNA-DNA的Tm值通常高于对应的DNA-DNA。一般来说，在100mM NaCl条件下，每增加一个碱基，其Tm值会提高约1°C。在低盐浓度的环境下，Tm值差异更加明显。通常情况下，含10个碱基的PNA，其Tm值约为50°C，而含15个碱基的PNA Tm值约为70°C。最佳的PNA序列长度为12至17个碱基。序列长度主要依赖于具体的应用，与DNA应用相比，PNA探针所需的长度更短。根据序列，较长的PNA链容易聚合，不易进行纯化和表征，然而短序列具有更强的特异性，因此对于短序列而言，匹配失误的影响更显著。

订单信息

PNA的报价依赖于序列长度、产量、纯度及修饰标记，您可将具体需求发送给我们，尊龙凯时人生就博将及时与您联系。最低订购量为：未标记PNA 20 nmole，标记PNA 10 nmole。可选择90%和95%的纯度，并提供HPLC纯度分析及质谱分析报告。一般而言，交货时间为2到3周，若为gamma PNA或修饰标记则需要3到4周。

精选引用

如需了解使用我们的PNA所发表的研究文献，可参考以下文献：- **Exponential Increase in an Ionic Signal: A Dominant Role of the Space Charge Effect on the Outer Surface of Nanochannels**，Anal Chem | 28 Sep 2021，所有单链PNA序列均由SBS Genetech Co, Ltd（北京，中国）购买。- **Peptide Nucleic Acid-Functionalized Nanochannel Biosensor for the Highly Sensitive Detection of Tumor Exosomal MicroRNA**，Anal Chem | 30 July 2021，PNA由SBS Genetech Co Ltd（北京，中国）合成，Table S1显示了上述提到的寡核苷酸序列。- **Ultrasensitive Exosomal MicroRNA Detection with a Supercharged DNA Framework Nanolabel**，Anal Chem | 2 April 2021，5'端含有−(CH2)6−间隔的硫醇化PNA由SBS Genetech Co, Ltd（北京，中国）合成和纯化，所有这些序列见Table S1。